南京市中医院的特色科室
医院有国家级中医重点专科3个：肛肠科、脑病科、妇科；国家临床重点专科（中医专业）2个：肛肠科、临床药学；国家级中医重点专科建设单位2个：肿瘤科、心血管病科；国家级重点专科培育项目2个：护理学、临床药学；江苏省中医重点专科2个：骨伤科、针灸科；江苏省中医重点专科建设单位2个：老年病科、急诊科；南京市中医重点专科4个：脾胃病科、肾病科、内分泌科、养生康复科；南京市中医重点专科建设单位2个：肺病科、风湿科。医院还拥有江苏省中西医结合结直肠肿瘤诊疗中心、南京市中西医结合癌痛镇痛中心、盆底中心、炎性肠病诊疗平台、围绝经期综合症诊疗平台等相关疾病诊疗平台，设有中医药研究所、结直肠病研究所及南京市医学重点实验室。
江苏省第二中医院的特色科室
江苏省第二中医院门诊部目前开设的临床科室有 ：心脏病、呼吸科、消化科、神经内科、肿瘤科、肾病科、外科、肛肠科、骨伤科、妇科、儿科、针灸科、推拿科、口腔科、眼科、耳鼻咽喉科、皮肤科等，其中针灸科为江苏省中医重点临床专科、肺病科为国家中医药管理局中医重点临床专科建设单位，骨伤科、脾胃病科为省级中医重点临床专科建设单位，具有一定的诊疗特色和优势。该院住院部核定病床数600张，现开设有心脏病、神经内科、消化科、肾病肿瘤、呼吸科、外科、骨伤、妇科、针灸、急诊及ICU等十一个病区。该院现拥有全新进口的核磁共振机（MRI）、超高端CT、进口彩超（含三维彩超）、进口DR、数字化胃肠机、GE心电综合分析系统、GE电子胃、肠镜、腹腔镜、宫腔镜、进口体外碎石机等高新诊疗仪器设备100多台（件）。 医学影像科医学检验科心电图室脑电图室B超室病理科呼吸功能检测室骨密度测定室肌电图室TCD室
